ในระบบนิเวศน้ำ สาหร่ายทั้งกลุ่มสาหร่ายขนาดเล็ก (microalgae) หรือที่เรียกว่าแพลงก์ตอนพืชและกลุ่มสาหร่ายขนาดใหญ่ (macroalgae) เป็นผู้ผลิตปฐมภูมิ เนื่องจากสามารถสร้างอาหารได้เองจากการสังเคราะห์ด้วยแสงและเป็นแหล่งสร้างออกซิเจนที่สำคัญ